2001年4月20日 滨洲线 黑龙江省安达市安达市车站 T47（北京―齐齐哈尔） 颠覆 机车乘务员盲目出乘，违章蛮干，超速行车；车站值班员严重违章，漏抄命令，盲目指挥；列车调度员违反规章，作业不规范，对命令执行不检查 2 50 5辆客车颠覆[19] [20]
2005年7月31日 京哈 辽宁省沈阳市新城子区 K127（西安―长春）
33219（货物列车） 追尾 信号电缆被盗 5 30 [21]
2006年4月11日 京九 广东省河源市 T159（青岛―广州）
1017（武昌―汕头） 相撞 信号故障，司机盲目行车；违反操作规定 2 18 [9]
2007年2月28日 南疆 新疆维吾尔自治区吐鲁番地区托克逊县 5807（乌鲁木齐―阿克苏） 脱轨 瞬间大风 3 34 南疆铁路中断
2008年1月23日
2008年胶济铁路列车撞人事故 胶济 山东省潍坊市 D59（北京―四方） 撞人 无资质包工队非法施工 18 9 [22]
2008年4月28日
2008年胶济铁路列车相撞事故 胶济 山东省淄博市王村站 T195（北京―青岛）
5034（烟台―徐州） 脱轨后相撞 铁路部门文件信息传达不力，超速通过限速施工便道导致脱轨 72 416 铁路中断行车21小时22分[23]
2008年5月12日 宝成 甘肃省徽县 21043（货物列车） 脱轨 汶川大地震导致山体崩塌，12节油罐车起火燃烧 0 2 109号隧道报废
2008年6月30日 黎湛 广西壮族自治区玉林市陆川县 1322（广州―重庆） 脱轨 山体滑坡掩埋线路 0 7 铁路中断行车35小时[24]
2009年6月29日
2009年京广铁路郴州站列车相撞事故 京广 湖南省郴州市郴州站 K9063（铜仁―深圳西）
K9017（长沙―深圳） 相撞 违反操作规定 3 63 [25]
2009年7月29日 焦柳 广西壮族自治区柳州市柳城县 1473（襄樊―湛江） 颠覆 路堑坍塌落石 4 34 [26]
2010年5月23日
2010年沪昆铁路列车脱线事故 沪昆 江西省抚州市东乡县 K859（上海南―桂林） 脱轨 山体滑坡掩埋线路 19 71 铁路中断行车19小时[27]
2010年8月19日 宝成 四川省德阳市广汉市 K165（西安―昆明） 脱轨 洪水冲垮桥梁 0 3 [28]
2011年1月14日 襄渝 湖北省襄阳市谷城县 5096（货运列车）
10906（货运列车） 追尾 机车撤砂后轨道电路失效 0 0
2011年7月23日
2011年杭深线动车组列车追尾事故 杭深 浙江省温州市 D301（北京南―福州）
D3115（杭州―福州南） 追尾颠覆坠桥 列控中心设备设计缺陷、上道把关不严、雷击应急处置不力 40 210 铁路中断行车32小时35分 [29][30][31]
2012年3月24日 陇海 陕西省宝鸡市拓石站 10520（货运列车） 脱轨 0 0 上行线中断8小时，三站两区间改为单线行驶[32]
2013年10月17日 沈山 辽宁省锦州市锦州站 930（货运列车） 脱轨 0 0 中断沈山线上行线行车，HXD3B型0214号和0430号机车大破[33]
2013年10月23日 青藏 青海省格尔木市格尔木东站近K806+890米处 7581（西宁―格尔木）
格尔木东站备用车 相撞 格尔木东站备用车溜逸 1 50余 [34]
2014年3月26日 娄邵 湖南省娄底市洪山殿至双板桥区间K131+696处 26326（货运列车） 脱轨 强降雨 0 0
2014年4月13日 滨北 黑龙江省海伦市海伦站至东边井站区间 k7034（黑河―哈尔滨） 脱轨 0 15 [35][36]
2014年6月19日 京广 广东省英德市高桥站至沙口站区间 T171（南昌―广州东） 脱轨 0 5 [36]
2014年6月25日 北黑 黑龙江省黑河市辰清站至清溪站区间 40291（货运列车） 脱轨 0 0 [36]
2014年7月12日 宜万 湖北省宜昌市长阳站至宜昌站区间 k504（成都―长沙） 脱轨 0 0 [36]
2014年11月21日 沪昆 湖南省娄底市娄星区花山办事处山塘村 未知车次（货运列车） 脱轨 0 0 9节货车脱线[37]
2014年11月24日 襄渝 陕西省安康市旬阳站至棕溪站区间 75228（货运列车） 脱轨 泥石流 2 0 机车和机后1-12车脱线，HDX1C型0033号机车报废[36]